تأسست مكتبة كلية العلوم في العام الدراسي 1966 بالتزامن مع تأسيس كلية العلوم. كانت تقع في الحرم الجامعي في الخالدية، وقد انتقلت إلى مدينة صباح السالم الجامعية، حيث تتواجد في المبنى الجنوبي لكلية العلوم. وتعد مكتبةً مرجعية أي أنها تحتوي على الكتب المرجعية ورسائل الماجستير والدكتوراه ومجموعات الأطلس والخرائط وعددها 9064 ، وهي تعنى بتوفير المصادر العلمية للمطالعة داخل المكتبة دون اعارتها خارجياً.

تحتوي المكتبة على مجموعة من الرسائل والأطروحات الجامعية والمراجع التي تخص:

• كلية العلوم
• كلية الهندسة والبترول
• كلية العلوم الإدارية
• مكتبة جابر الأحمد
• كلية العلوم الحياتية

كما تحتوي مكتبة العلوم المرجعية في الدور الأول على قاعة دراسية مفتوحة، ومختبر حاسوب وغرف دراسية لأعضاء هيئة التدريس وطلبة الماجستير.

وقد تم دمج مجموعات الكتب والدوريات التابعة للكليات سابقة الذكر مع باقي المطبوعات في المكتبة المركزية.